一般来说，超声波清洗机清洗的工艺流程依被清洗物体清洗的难易程度及清洗数量而决定。主要清洗流程如下：
1)热浸洗或喷洗：目的是将工件上的污染物软化、分离、溶解，并减轻下道清洗工序的负荷。
2超声波清洗机清洗：利用超声波产生的强烈空化作用及振动将工件表面的污垢剥离脱落，同时还可将油脂性的污物分解、乳化。
3)冷漂洗：利用流动的净水将已脱落但尚浮在工件表面上污物冲洗干净。
4)超声波漂洗：溶剂为干净的清水，工件浸入后，利用超声波将浮在工件各边、角及孔隙处的污物清洗干净。
5)超声波清洗机热净水及冷净水漂洗：进一步去除悬附在工件表面上的污物微粒。
6)超声波清洗机热风烘干：利用一定的温度和风速，使零件表面快速干燥。